«АТФ-Банк Кыргызстан» регулярно работает над расширением сети филиалов и сберегательных касс в регионах Кыргызстана. Первые филиалы Банка открылись в 1999 году в городах Карабалта и Балыкчи.

В 2001 году был открыт пятый филиал банка в г. Каракол. Филиальная сеть банка на тот момент насчитывала  пять филиалов, расположенных в стратегически важных городах республики: Карабалта, Балыкчи, Ош, Талас, Каракол.

В 2002 году был открыт филиал в городе Жалалабад, что является показателем стабильного роста и развития Банка в целом и филиальной сети.

2004 год стал важным годом в процессе развития и усиления филиальной сети «АТФ-Банк Кыргызстан». 8 октября 2004 года был презентован Бишкекского филиала ,в последствии Филиал «АТФ-Банк Кыргызстан» № 1, таким образом, объявив о начале операций в центре г. Бишкек.  

На данный момент филиалы «АТФ-Банк Кыргызстан» расположены в городах Бишкек, Ош, Жалалабад, Талас, Токмок, Карабалта, Каракол, Балыкчи.

В регионах также широко представлена сеть сберегательных касс «АТФ-Банк Кыргызстана», которые располагаются в Бишкеке, Оше, Узгене, Ноокате, Карасуу, Кызылкие, Жалалабаде, Кочкорате, Шамалдысае, Масы, Канте, Сокулуке, Караколе, Нарыне.

«АТФ-Банк Кыргызстан» является членом UniCredit Group, финансовой группы мирового уровня с более, чем 500 летней историей. Чтобы соответствовать высоким требованиям финансовой группы UniCredit Group, «АТФ-Банк Кыргызстан» регулярно ведет работы по улучшению качества предлагаемых услуг и внедрению новейших принципов менеджмента, которыми руководствуются ведущие банки Европы.